Храм Света Троица е построен върху основите на старата църква Св. Петка, която датира от 1868 година.
Църковните икони, олтарът и църковната утвар са пренесени от Одрин, от българската църквата Св. Св. Кирил и Методий.
Една от най-ценните икони в нея е чудотворната икона на Богородица, наричана тук Покровителка на единството между християните.
Малко Търново е един от българските градове, в които католическата църква навлиза посредством униатското движение - форма на католицизъм, комбиниран с православни обреди.
Не могат да се отрекат заслугите на униатите за пробуждането и възраждането на малкия градец в условията на робство.
През 1868 година те осветяват свой храм по-късно в близост е издигната днешната действаща църква Света Троица.